proxima compra; valor catastral mucho mas alto que el precio de compra

Hola, tenemos todo preparado para firmar la compraventa de una casa en la ciudad de Dos Hermanas en la provincia de Sevilla.
Hemos pactado con el vendedor un precio de 135.000€ y cuando hemos consultado el valor catastral de referencia nos ha sorprendido ver que es de 213.231,33€. Muy superior al precio que vamos a pagar por el inmueble.
El inmueble se encuentra en una zona ERACIS (Estrategia Regional Andaluza para la Cohesión e Inclusión Social). Las Zonas Desfavorecidas de la Comunidad Autónoma Andaluza, definidas como aquellos espacios urbanos claramente delimitados, en cuya población concurran situaciones estructurales de pobreza grave y marginación social, y en los que sean significativamente apreciables problemas en las siguientes materias:

-Vivienda, deterioro urbanístico y déficit de infraestructura, equipamiento y servicios públicos.
-Elevados índices de absentismo y fracaso escolar.
-Altas tasas de desempleo junto a graves carencias formativas profesionales.
-Significativas deficiencias higiénico sanitarias.
-Fenómenos de desintegración social.

A esto se suma que el inmueble esta inscrito en el registro de la propiedad como NAVE-LOCAL, no como VIVIENDA.
¿Puedo utilizar estos motivos para la impugnación del valor catastral de referencia?
¿Es mejor liquidar utilizando el valor de referencia, siendo el valor de compraventa menor, y solicitar rectificación de autoliquidación a posterior o
liquidar por el valor de compraventa y después recurrir el procedimiento de comprobación realizada por la Administración?
GRACIAS