Liquidacion complementaria: Obra nueva en suelo rústico

Buenos días Cristina,
Lo primero agradecerte el trabajo que estás haciendo y la ayuda que hallamos en esta web a los que nos encontramos en la situación de que recibimos una liquidación complementaría y estamos completamente perdidos.
He leído la mayoría de los casos y no he encontrado ninguno similar así que te agradecería muchísimo tú orientación.
En mi caso la complementaría les ha llegado a mis padres por la liquidación de obra nueva de una nave almacén construida en suelo rústico para uso agrario. La nave está en Cantabria.
Es un caso especial, puesto que cómo la han ido construyendo ellos mismos en la medida de sus posibilidades, la construcción de la misma se ha alargado durante unos 18 años.
En el 2011 se termino la obra, y la fecha de devengo de autoliquidación fue el 18/01/2012, por un valor de la nave de 90.000 euros y pagando 900 euros del impuesto (el 1% para este tipo de tramites). El jueves 11 de este mes les ha llegado a mis padres dos cartas de propuesta de liquidación en la que valoran la nave en 245.700 euros, por lo que les piden 2.457 euros (50 % a cada uno, menos lo que ya liquidaron).
La valoración la han hecho mediante un perito (arquitecto técnico) de la administración, en la que multiplica un Coste de Ejecución (que no dice de donde lo saca) X un Factor de Actualización (edad, calidad, conservación=(6 años, industrial-espectáculos; medio)=0,9) X la superficie de la nave según catastro (910 m2). No se indica que normativa está utilizando para considerar esos parámetros.
Una de las cosas que más temen mis padres es que esa nueva valoración la traspasen a catastro y que a partir del próximo recibo del IBI, tengan que pagar la contribución multiplicada casi x3. Ya que ahora mismo catastro tiene valorada la construcción en 81.945 euros, bastante similar a los 90.000 que se habían indicado en la autoliquidación.
¿Es eso posible, que con esa nueva valoración en caso de aceptarla actualicen el valor de catastro? ¿conoces algún caso, o alguien del foro conoce algún caso en que eso haya ocurrido con una propuesta de liquidación sobre una obra nueva?
En cuanto a las alegaciones tenía pensado indicar las siguientes:
– Falta de motivación, al no indicar de dónde sacan los precios de construcción ni que normativa han utilizado para aplicar los coeficientes de actualización.
– Falta de visita para comprobar el estado de conservación del inmueble.
-Indicar mediante fotografías de 2001 que el volumen de la edificación ya estaba construido para esa fecha a excepción de acabados. Para demostrar una edad mayor del inmueble
Si no te parece mal, te enviaré un mail con la propuesta de liquidación y alguna duda más, para ver cómo puede ser la mejor forma de enfocarlo. Muchísimas gracias por adelantado.