Buenos días,
Cristina el problema ha sido solucionado. No he tenido que hacer nada, la propia AEAT he emitido tres comunicaciones (electrónicas)comunicándome que tras el fallo del TEAR había procedido a reembolsar en mi cuenta corriente lo que me daba a devolver en la declaración original, a reembolsar los 3.500€ pagados por la paralela de la AEAT así como el pago de mas de 1.300€ por los intereses de demora generados. Esto último me genera casi mas felicidad que lo otro.
Lo dejo por aquí para que pueda servir de experiencia para alguien.
Muchas gracias por todo

Muchas gracias Cristina.
Yo esperaba que después del varapalo que tanto la AN como el TS dieron a la AEAT con relación a su inacción cuando los actos son desfavorables para ellos, hubieran corregido algo y piensen que su obligación también es de servicio al contribuyente, que eso somos y no súbditos.
He accedido vía telemática al expediente y allí tienen todo (menos la resolución que aún no les ha llegado). Mi liquidación es fácil, ellos hicieron la paralela a mi declaración. El TEAR anula el acto que ellos impugnaron, luego mi primera declaración es la que prevalece.
Podrían hacer otra paralela pero no creo que se molesten, tengo poco y todo por nómina, soy casi transparente ?.
Esperaré un poco por si alguien tuvo una experiencia similar y me ilumina, luego presentar un escrito solicitando la devolución y adjuntando la sentencia si es que no la reciben antes.