Valor de la tasación hipotecaria como base imponible.

Hola, en primer lugar agradecerte la labor que realizas y animarte a que lo sigas haciendo así.
El pasado año compré una vivienda en Cádiz, el precio de la misma quedo establecido en 129500 euros.
En base a dicho valor de compra, ser mi mujer menor de 35 años y destinar el inmueble a vivienda habitual desde la gestoría del banco que nos tramita la hipoteca, se nos hace una provisión de fondos aplicando el tipo reducido del 3,5% y 0,3 % en cuanto al ITPAJD.
El día antes de la firma me avisan desde la gestoria y me dicen que el departamento de riesgos del banco ha determinado que si bien el valor de compra de la vivienda es de 129500, la liquidación de impuestos se ha de llevar a cabo tomando como valor el que establece la Junta de Andalucía, que en este caso sería 144000 euros (resultante de aplicar el valor catastral por el coeficiente)
Ante mi desconocimiento accedo a ello y se lleva a cabo la liquidación de esta forma. Al superar en este caso la cantidad de 130000 euros no cabe la aplicación del tipo reducido en cuanto al ITPAJD por lo que el pago de impuestos se lleva a efecto aplicando el tipo general del 8% y 1,5% respectivamente, o lo que es lo mismo me supone un desembolso aproximado de 9000 euros más con respecto a si se hubiera llevado a cabo en base al tipo reducido.
AL no quedar muy conforme con lo ocurrido intento averiguar si la forma en la que se ha llevado a cabo la liquidación es correcta o no.
Tras varias días preguntando a conocidos, internet, Junta de Andalucía,… llego a la conclusión de que debería haber liquidado por el tipo reducido y que, llegado el caso, hubiera sido la administración la que me reclamara.
Que si bien hubiera sido muy probable que me enviaran una liquidación complementaria, lo que había hecho era adelantarme a ello y pagar lo que aún no me habían requerido.
Al trasladar al banco y la gestoría lo expuesto y no obtener ningún tipo de respuesta satisfactoria, en el mes de julio del presente año y a través de otra gestoría se me plantea la posibilidad de hacer una reclamación de impuestos indebidos, en base a que he autoliquidado por una cantidad superior a la debiera.
El pasado martes recibo la respuesta a dicha reclamación, argumentando que he realizado el pago de impuestos por un valor inferior al real, esgrimiendo que la tasación que se realizó para la solicitud del préstamo hipotecario y que consta en la escritura de compra determinó que el valor de la vivienda era de 173000 euros, por lo que me reclaman 2400 euros más.
O sea, que en vez de aceptar mi solicitud de ingresos indebidos, me envían una propuesta de liquidación complementaria.
¿Crees que si reclamara conseguiría algo?
Gracias y saludos.